本平台和团队针对我国每年产生大量固体有机废弃物随地弃置而污染环境、我国土壤微生物区系日益破坏而导致土传病害猖獗的现实，着重研究高产和健康土壤微生物区系的特征、生物有机肥调控土壤微生物区系的机制、功能菌在根表和根际的行为特征、堆肥和生物有机肥二次固体发酵的生物学特征等。在过去的十五年间，上述研究内容在国家973计划、重点研发计划项目和课题、863计划、支撑计划以及农业部行业专项和重大948滚动项目以及国家基金重点和面上项目等的资助下，开展了深入广泛地研究，发表了180多篇SCI论文，发表期刊包括国际著名刊物Nature Communications, Ecology letters, The ISME Journal, Biotechnology Advances, Nucleic Acids Research, Environmental Microbiology, Soil Biology and Biochemistry, Biofuel and Biotechnology, BMC Genomics, Applied Environmental Microbiology等，获得了80多个发明专利，形成了一支具有国际学术影响和国内产业技术竞争力的研发团队，有机肥与土壤微生物团队获农业部优秀创新团队奖。典型成果如下：（1）揭示了有机肥制造中的生物学过程和施入土壤后的作用机制，并建立了商品有机肥和有机无机复混肥制造新工艺。该成果获2015年国家科技进步奖二等奖和2013年教育部科技进步奖一等奖。（2）揭示了根际有益菌作用机制，并形成根际微生物区系调控技术体系。该成果获2011年国家技术发明奖二等奖和2010年江苏省科学技术奖一等奖。（3）研发出利用病死畜禽水解性氨基酸和秸秆制造木霉固体菌种及秸秆直接制肥工艺，该成果获得教育部科技进步一等奖，中国专利优秀奖和大北农科技奖。中心成果转化20多家企业，为我国固体废弃物资源化利用提供了可行的途径。

学术委员会主任：蔡道基研究员（工程院院士）

研究中心主任：沈其荣教授